Basespace
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新產品
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- 線上監看定序結果：只要打開網路瀏覽器，隨時皆能掌握定序資訊。
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- 即時線上備份與資料分析：定序的同時上傳及分析定序資料，節省你寶貴的時間。
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- 智慧靈活的資料共享：透過帳號管控，可將資料安全的分享給不同的使用者。
- 一鍵輕鬆完成分析工作：僅需滑鼠點選希望使用的APP軟體，即可輕鬆完成分析工作。
BaseSpace是Illumina推出專為次世代定序資料生物資訊需求所設計的雲端分析與計算平台。BaseSpace讓實驗室能夠有效節省數據分析軟體的投資及電腦設備維護的相關費用，讓使用者能更專注於研究。BaseSpace平台除了提供使用者一個無風險的資料備份方案，使用者能透過寄送連結或是iCom帳號認證的方式，安全的將你的定序結果共享給其他的使用者。針對使用者在分析上需求的不同，BaseSpace平台以APP (Application) 程式的形式提供了多元化的對應分析軟體 ，無需繁瑣的指令輸入與程式安裝，只要使用者對欲使用的APPs進行簡單的點選，即可順利完成分析。這些應用程序可即時（on the fly）購買或每次分析時購買，未來也會支援更多內部開發與第三方的分析軟體。
快準備和分析伺服器架設說再見，一同加入BaseSpace遨遊雲端、輕鬆駕馭次世代定序資料!
平台特色：
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- 線上監看定序結果：只要打開網路瀏覽器，隨時皆能掌握定序資訊。
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- 即時線上備份與資料分析：定序的同時上傳及分析定序資料，節省你寶貴的時間。
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- 智慧靈活的資料共享：透過帳號管控，可將資料安全的分享給不同的使用者。
- 一鍵輕鬆完成分析工作：僅需滑鼠點選希望使用的APP軟體，即可輕鬆完成分析工作。
有效系統整合：
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在MiSeq與HiSeq控制軟體（MCS and HCS）中，只需在測序運行開始時選擇使用BaseSpace來儲存和分析，儀器便會將數據以無縫接軌方式傳送到雲端進行自動化的分析和儲存。您也可與合作者隨時隨地分享定序資料及分析結果，並儲存無限的數據。 |
雲端資料管理：
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BaseSpace用戶可立即與全球任何角落的合作者分享定序資料。目前有兩種選擇：通過聯結分享（Sharing by Link）和通過用戶名稱分享（Sharing by Name）。 通過聯結共享時，資料擁有者創建一個獨特的鏈接，並發送給合作夥伴。資料擁有者擁有刪聯結權力，並能檢閱使用狀況。 通過名字共享時，資料擁有者只需管理一份用戶電子郵件列表，即可控制存資料取權力。 |
強化資料安全：
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BaseSpace 是Illumina與Amazon Web Services（AWS）合作所架設的雲端資料分析平台。所有的資料上傳時都經過過物理、電子和行政加密措施，而得到有效保護。上傳數據通過AES256標準加密，並受到SSL保護。AWS平台安全性已通過反覆測試，確保BaseSpace可滿足、甚至超越了大部分機構對於資訊系統的安全性要求。 |
簡化資料分析：
BaseSpace利用雲端軟體應用程式，可幫助實現自動化的生物資訊分析。 BaseSpace目前擁有6個獨立的數據分析應用程式， 利用Illumina Experiment Manager（Illumina實驗管理系統），在樣品表設置時選擇好所需的分析，便能在實驗開始後將資料直接傳輸到BaseSpace。定序完成後自動開始進行指定的分析流程，無需使用者干預。 分析在幾小時內完成，並自動產生報告。
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重定序(Re-Sequencing): 重定序流程將樣品中的DNA與已知的reference genome進行比較，並找出其中的變異 (SNPs or indels) |
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Denovo組裝: 由定序實驗中產出的sequencing read，組裝一個新的基因組 (Velvet支援) |
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Custom Amplicon分析: 找出短片段，客製化PCR Amplicon中的變異 |
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總體基因體學(Metagenomics) 流程: 利用16S rDNA基因分析結果來了解環境基因體的代謝特性與多樣性 |
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Small RNA分析: 讓研究者分析樣品中小分子RNA序列分部的多寡，特別是不同miRNA種類的定性與定量，並可比較不同樣品中的表現量 |
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Library QC: 流程目的在重於評估DNA libraries中的片段長度分布和樣品品質 |
詳細資訊請參考：
https://basespace.illumina.com/home/sequence
http://res.illumina.com/documents/products/technotes/technote_basespace_security.pdf
http://res.illumina.com/documents/products/datasheets/datasheet_basespace.pdf