Whole-Genome Genotyping and Copy Number Variation Analysis

Whole-Genome Genotyping and Copy Number Variation Analysis

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Genome-wide association studies (GWAS) 是指在人類全基因組範圍內利用存在的序列變異,即單核苷酸多型性 (SNP),並從中篩選出與疾病相關的 SNPs

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近年來由於 1000 Genomes Project (1kGP) 快速地發展,幾乎可辨認人類族群中任何存在頻率的序列變異;Illumina 利用此資料庫設計一系列的全基因體基因型鑑定產品-Omni 家族,最高階的晶片包含 500 萬個 SNPs 位點,其中 SNP 的 minor allele frequency(MAF) 可低至 1%,此外,Omni 家族的設計也提供研究者省時且經濟的方法:當最新的 SNPs 發佈時,研究者可利用增補 SNPs 的方式,逐步地完成 500 萬個 SNPs 之基因型鑑定。

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Omni 家族產品內容:

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HumanOmniExpress:
http://www.illumina.com/products/human_omni_express.ilmn

HumanOmni1-Quad:
http://www.illumina.com/products/humanomni1_quad_beadchip_kits.ilmn


HumanOmni2.5_8:
http://www.illumina.com/products/humanomni25_quad_beadchip_kits.ilmn

HumanOmni5-Quad:
http://www.illumina.com/products/humanomni5-quad_beadchip_kits.ilmn

專為華人族群所設計的 GWAS Array_OmniZhongHua-8

wgcnv-3.jpg OmniZhongHua 晶片特別地覆蓋了華人族群中所發現的常見與稀有變異,適用於全基因組關聯研究 (GWAS)。採用優化的 Tag SNP 內容來自 HapMap 所有三個階段以及千人基因組計畫 (1KGP),經過策略性選擇而創建出聚焦特定華人群體的晶片,可用於華人中探索全新的疾病和性狀關聯研究。
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